Благодаря этому можно будет лучше прогнозировать развитие опухоли, надеются ученые.
Биоинформатики выяснили, что вероятность выживания пациентов с глиобластомой мозга можно предсказать по тому, насколько много их организм вырабатывает молекул некодирующей РНК CRNDE. Об этом пишет пресс-служба МФТИ со ссылкой на статью в журнале Cancers.
Глиобластома – это один из самых распространенных типов рака мозга. Каждый год подобные злокачественные опухоли возникают примерно у 300 тыс. жителей Земли. Большинство пациентов умирают от глиобластомы за срок от 12 до 18 месяцев, через два года после постановки диагноза живы остаются только 9%.
«В ходе исследования мы изучили несколько сотен образцов глиобластомы и обнаружили единственный ген, который показывал высокий биомаркерный потенциал – он связан с некодирующей РНК CRNDE. Чем выше активность этой РНК, тем ниже выживаемость пациентов», – отметил один из авторов работы, руководитель лаборатории МФТИ Антон Буздин.
Буздин и его коллеги выяснили, что вероятность развития самых агрессивных форм глиобластомы можно оценить по уровню активности гена, который содержит в себе инструкции по сборке РНК-молекулы CRNDE. В этой цепочке нуклеотидов нет инструкций по сборке белков, однако она влияет на активность многих других генов. В прошлом ее уже обвиняли в провоцировании разных форм рака.
В ходе нового исследования ученые выявили связь между активностью CRNDE и вероятностью выживания носителей глиобластомы. Они выясняли, как различается уровень активности генов в здоровых и раковых клетках. Подобным образом ученые пытались понять, как работа разных участков ДНК влияла на агрессивность опухоли.
Для получения этих сведений ученые изучили образцы клеток глиобластомы, которые были извлечены из тканей мозга нескольких сотен пациентов, проходивших лечение в России, США, Евросоюзе и Китае. Буздин и его коллеги проанализировали, насколько активны были гены в каждом наборе раковых клеток, и сопоставили эти сведения с тем, насколько агрессивными были порожденные ими опухоли.
Подобный подход позволил ученым обнаружить, что лишь один из изученных ими участков ДНК соответствовал всем критериям отбора. Им оказался ген, кодирующий РНК-молекулу CRNDE. Чем больше ее цепочек присутствовало в организме пациента, тем быстрее он погибал от глиобластомы.
Ученые надеются, что благодаря этой особенности можно будет более точно прогнозировать, как будет развиваться опухоль у того или иного пациента, и выбирать наиболее оптимальные меры по продлению их жизни и облегчению симптомов болезни. Кроме того, изучение механизмов работы CRNDE позволит понять, какие факторы влияют на развитие глиобластомы, и раскроет потенциальные способы торможения ее роста.